Η πρόπολη , έχει ευρύτατο μικροβιοκτόνο φάσμα.
Σύμφωνα με πολυάριθμες μελέτες έχει αποδεδειγμένη δράση κατά ιών, συμπεριλαμβανομένων της γρίπης, του Η1Ν1 και Η1Ν3. Mπορεί να χρησιμοποιηθεί για την αντιμετώπιση μιας ίωσης, επιταχύνοντας την ανάρρωση και αμβλύνοντας τα συμπτώματα.
Η αντιμυκητιακή δράση της πρόπολης έχει επιβεβαιωθεί και επιστημονικά εναντίων της Candida albicans, κολοβακτηριδίων και άλλων βακτηρίων και μυκήτων. Πολύ σημαντικό είναι ότι η μακροχρόνια χρήση πρόπολης δεν οδηγεί στην δημιουργία ανθεκτικών στελεχών παθογόνων μικροοργανισμών, ενώ παράλληλα καταστρέφει το ίδιο εύκολα παθογόνους μικροοργανισμούς που έχουν γίνει ανθεκτικοί στα αντιβιοτικά.
Η πρόπολη είναι αποτελεσματική και στην αναστολή των παρασίτων, όπως τριχομονάδες, τρυπανοσώματα κτλ . Η αντιπαρασιτική της δράση οφείλεται στην αναστολή της πρωτεινοσύνθεσης. Μελέτες έχουν αναφέρει τις αντιπαρασιτικές ιδιότητες της πρόπολης έναντι των: Trypanosoma cruzi, Trichomonas vaginalis και του κοκίτη. Σε άλλες κλινικές μελέτες καταγράφηκε η δράση της κατά των παρασίτων του γένους Giardia και η in vitro παρεμπόδιση της ανάπτυξης των G. duodenalis trophozoites.